世田谷一家殺害事件
發生於2000年12月30日，住在東京世田谷區的宮澤家一家四口慘遭滅門。兇手在行兇時表現冷血，連兒童都身中多刀，宮澤太太的上半身及頭部甚至被毀容至無法辨識。而根據日本警方判斷，兇手在行兇後極有可能在案發現場逗留超過10小時以上，並有意無意間於現場遺留下大量指紋、血跡、鞋印、個人物品，甚至在現場吃雪糕以及使用電腦上網購買表演門票。雖然如此，由於沒有決定性的物證，警方至今仍無法確認兇手是誰。本案的懸賞金額高達兩千萬日元，同時日本警視廳也罕有地為此案製作了英文、中文與韓文版的案件簡介跟通緝令，希望能擴大蒐集資訊。
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三億日圓搶案
這是1968年12月10日發生在日本東京都府中市的現金搶劫案，現場遺留多達120件證物，卻因為日本警方的過於自信，許多證物反而無用。而至今尚未抓到犯人，且此案已經過了追訴期。
其巧妙的作案手法，是日本歷史上最神秘的案件之一，被視為完美犯罪。去除通貨膨脹因素，也是日本迄今為止被盜金額最大的案件。也因此被許多小說、電影、電視劇當作題材。
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東京八王子市的超市殺人案
發生於1995年7月30日，在東京八王子市的一間超市，有三位女性員工被發現死在超市二樓的辦公室裡。她們都被用膠帶綑住，而且頭部都被射兩槍。警方懷疑這是一起強盜殺人案，但卻沒有任何錢被拿走。研判兇手使用的凶器是菲律賓製的禁槍，但也沒有任何更明確的線索。
此後有找到過幾個嫌疑人，但都沒有直接證據確認就是這起超市殺人案的兇手，至今仍是一起讓人匪夷所思的案件。
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井之頭恩賜公園分屍殺人事件
這起事件發生在1994年4月23日，一位女性清潔員在整理公園內的垃圾時，發現了一隻人腳跟一些裝著屍體的垃圾袋，事件就此曝光。之後在警方的調查下，於該公園附近發現了共27段手腳、身體被切塊裝入黑色塑料袋，分別丟棄在了7個垃圾桶內。
讓人感到可怕的是，兇手在分屍前還仔細的放血，且手腳上的指紋都被去除，警方只能透過僅剩的一小部分指紋，證實被害人是住在井之頭公園附近的一名35歲男性建築師。除了手腳外，其他部分都被完整切割成20公分大小，剛好是垃圾桶口的尺寸。找到的屍塊也不是人體的全部，剩下三分之二的部分，包含頭部以及軀幹的大部分至今仍然尚未找到。
這宗案件被懷疑與邪教儀式有關，不過從被害人交友情況等方向搜查，沒有發現任何符合的嫌疑對象。直到2009年4月23日此案追訴時效屆滿，犯案動機亦未能查明。
圖/井之頭恩賜公園官方網站
福島便池藏屍案
這件超離奇案件發生在1989年，堪稱是日本最噁心的懸案。事件發生於福島縣都村路古道小學，這間學校是一所位於深山內的偏遠學校，且當地居民人數稀少，僅有3,000多人。
當時一名女老師上廁所時瞥見馬桶內有異樣，就到外面的污水井一探究竟，居然發現有一隻腳！之後警方使用起重機破壞了馬桶之後，發現有一名男性屍體在裡面，全身赤裸並手抱著衣服呈現奇怪的姿勢。經調查發現被害者的死因是失溫和窒息，但是在這麼狹小的空間，一般男性是無法順利進入的，即便後續調查出一些關於被害者的日常生活，可能有一些蛛絲馬跡，但還是沒有直接的證據找出兇手是誰。
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名古屋孕婦剖屍被殺案
1988年3月18日，名古屋有一名孕婦在家中電暖桌旁死去，其脖子上纏繞著電暖爐的電源線。死者當時雙腳張開，還有一個滿身是血的嬰兒正虛弱地哭泣。死者丈夫回家看到這景象立刻跑到玄關要打電話報警，找不到電話只看到被扯斷的電話線。而孩子經過搶救後，奇蹟似地活下來了。
警方調查發現，27歲的死者胸部到下腹部有一道切痕，子宮也被切了一道刀口，研判犯人是從這裡拉出胎兒。嬰兒的臍帶被隨意剪斷，大腿內側、膝蓋和睪丸被人切割數刀。而被害人的子宮裡面更被硬塞入電話機、以及掛了車匙的米奇老鼠造型鑰匙圈。
遺體沒有受到強暴的跡象，也沒有激烈抵抗的痕跡，只有死者錢包不見。現場指紋全被擦拭乾淨，洗手台也有將血沖洗掉的痕跡。
丈夫一度受到懷疑，但是他回家前一直待在公司，有完整的不在場證明。此案在2003年3月18日過了公訴有效時限，成為一大懸案，至今仍找不到兇手。
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氰化鈉可樂無差別殺人事件
1977年1月，東京都港區某處電話亭突然出現一瓶未開封的可樂，有一名路過的高中生將可樂帶回家後喝了一口便倒地不起，緊急送醫後不治死亡。第二天在該電話亭不遠處發現一名46歲藍領職員的屍體，旁邊也有一瓶打開的可樂，詭異的地方是，這兩人的死因都是氰化鈉中毒。
此後，一名公司總經理在東京站發現大量巧克力並送到警察局，經調查發現，果然也混入了氰化鈉。
這次事件持續了1個半月，造成東京都人心惶惶，警方懷疑此事有可能是年輕人或容易拿到氰化鈉的塗料廠工人所為，但始終未能鎖定犯人，成為懸案之一。
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固力果・森永事件
這一案件發生在1984年至1985年期間，以江崎固力果食品公司社長江崎勝久被綁架、索要贖金為開端，最終發展成犯人向眾多日本食品企業發出投毒威脅索要贖金的犯罪案件。在當時的日本社會造成了非常重大的影響，日本警察廳動員了大量的人力物力參與偵查這一案件，最多時有130萬名調查人員在全國各地參與本案，警方調查了近12萬5千名涉案人員，獲得2萬8千條線索，但至今未將罪犯捉拿歸案。
本次案件被人們視為完美犯罪，其影響也延伸到日本國境以外，引發了本國以及其他國家的罪犯跟進模仿。罪犯自稱為「怪人二十一面相」，其模仿江戶川亂步筆下的虛構人物「怪人二十面相」，而臺灣、香港則翻譯為千面人。本案也被稱為「怪人二十一面相事件」或「森永千面人」事件。
值得慶幸的是由於罪犯每次都會事先預告，並沒有人因為有毒食物而受到身體傷害，但相關企業仍受到巨大的經濟和名譽損失的。
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